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测序周报:这一周,很值得纪念!

201610-14
33JP摩根健康大会

本周,在美国旧金山举行的第33届JP摩根健康大会(The J.P. Morgan Healthcare Conference,JPM)已圆满落下帷幕,全球400多家医疗健康相关公司的高管们齐聚现场。以下是本届大会部分企业的消息盘点:

Illumina首席执行官Jay Flatley重磅发布了4款最新的测序仪分别是:HiSeq X Five系统,HiSeq3000,HiSeq4000以及Nexseq550。HiSeq X Five是X-Ten的精简版,该平台将在2015年第二季度正式销售。

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华大基因CEO王俊在大会报告中表示,计划今年推出两款基于CG技术的下一代测序系统。其中的一套将是一大型高准确率的高通量测序系统;而另外一套则是桌面化的测序仪,并可自动进行样本制备。

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10X Genomics公司正式亮相,该公司成立至今已3年,却一直秘而不宣,专注解决与攻克测序技术难题。该公司的测序仪加上试剂的售价是7万5千美金。这个价格能让更多科研机构拥有自己的测序仪,同时消耗极少量的生物样本。

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罗氏宣称将出资10.3亿美元收购FoundationMed公司超过半数的股权,接下来将共同合作癌症的免疫治疗和基于外周血的癌症预后监测两个方面。

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Affymetrix公司宣布,该公司在未来一年将扩大癌症基因组学业务;扩大基因分型业务;推动和扩张单细胞测序业务;发挥与Ariosa公司在生殖健康诊断的合作伙伴关系。

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Thermo Fisher Scientific公司表示,该公司最大的投资就是NGS技术研发和平台建设,Ion Torrent技术应用的重点仍然是癌症相关研究。

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Bio-Rad公司将新一代测序技术投入商业化大约有一年时间,目前的重点是微流体试剂盒。

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NanoString 公司表示,该公司仍有望在2015年推出第三代NCounter系统以及蛋白质组学应用平台。

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Luminex公司表示该公司未来收入的关键就在分子诊断业务上。Aries高通量分子诊断系统是Luminex公司发展的重点。

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BioNano Genomics公司CEO告诉投资者,该公司将在2015年开始采用长reads测序的Irys系统进军临床诊断领域。此外,BioNano还计划完成Irys三代芯片的开发。

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Exact Sciences公司宣布其2014年在第四季度,大肠癌检测带来150万美元收入,该公司的大肠癌诊断试剂盒是第一个也是唯一一个由美国FDA批准的检测粪便DNA的试剂盒。

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Cepheid公司期望在2015年底在全球拥有24项检测服务,该公司的新技术将会首先应用于乳腺癌的诊断,并预计在2016或2017年推出。

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Biocartis公司表示计划在Idylla分子诊断平台上进行更多的实验。预计今年推出KRAS和NRAS检测。明年的重点将包括申请癌症生物标志物。

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GenMark诊断公司推出全自动分子诊断平台,现已提交美国食品和药物监督管理局(FDA),并计划于2015年中在欧洲推出,2016年上半年在美国推出。

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Accelerate Diagnostics公司计划在欧洲推出临床微生物检测平台,获得欧盟的CE标志,并为提交美国FDA做准备。该公司已与FDA接洽多次。

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Genomic Health公司希望新一年,前列腺癌和乳腺癌检测试剂盒能在年底前实现盈利;推进液体活检项目。

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Myriad Genetics公司表示由于Myriad业务全球化,2014年公司财政年度显示,国际收入占45%,比上年同期增长109%。2015年公司计划在欧洲达到营业额5000万美元。

 

摩根效应!“会外会”成高端交易市场

生物技术公司、国际大药厂、风险投资公司,信息技术公司、会计师事务所,医疗保险公司......各色人等统统聚集JPM现场。会上会下各种生意都有,大家都忙得不亦乐乎!今年,JP摩根健康大会召开之际,各大公司间达成的合作也频频亮出!下面,对本次大会这期间的一些主要合作结果进行盘点,不论这些合作是否在JPM会场周围达成,都将其统称为“摩根效应”吧!

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12日,Personal Genome Diagnostics(PGDx)公司和 Human Longevity公司宣布签署合作协议。Human Longevity公司将获得PGDx癌症基因组分析芯片和PGDx企业解决方案平台的使用权。

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12日,23andMe公司宣布与辉瑞公司达成协议。根据协议,辉瑞将获得23andMe超过80万份个体基因型数据,用于更好地了解狼疮的遗传机理。

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12日,Genalice公司与Knome公司签署合作协议,结合Genalice Map数据分析软件和KnoSys基因组解析平台共同为客户提供下一代测序数据分析服务。

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12日,Genomic Expression公司和 Kew Group公司宣布将合作推出基于下一代测序技术的癌症检测芯片。

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13日,Advanced Biological实验室宣布与位于克利夫兰市的大学医学院中心合作利用新一代测序法分析和验证HIV人群的耐药情况。

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13日,Thermo Fisher公司签署经销协议购买Cynvenio Biosystems公司的LiquidBiopsy 平台。该平台能从血液中提取和分离循环肿瘤细胞,用于细胞成像和基因组分析。

 

卫计委:NIPT高通量测序临床试点

上周,测序中国官方发布消息,卫计委妇幼保健服务司已经批准全国108家医疗机构开展高通量基因测序产前筛查与诊断(NIPT)临床应用试点。其中,湖北省获批11家,位居全国省份第一。山东省获批10家,位居第二。北京、上海分别有6家和4家医疗机构试点获批。这远远高于此前医政医管局发布的第三方检验机构的数目。本次《通知》照比此前医政医管局发布的要详细的多。不仅明确规定了高通量基因测序NIPT在临床上的适用范围,并且严格制定了其临床服务流程。

资讯精选

01 苏格兰两大学预购15HiSeq X用于国民健康

近日,Illumina公司与爱丁堡大学、格拉斯哥大学达成合作,将为两所大学安装共计15台HiSeq X 测序仪,用于苏格兰基因组学研究。该项目投资金额达1千5百万英镑,由格拉斯哥大学的Wolfson Wohl癌症中心医学基因组学领导。

02 Foundation Med公布年入6千万美元

1月12日,Foundation Medicine对外宣布该公司2014年第四季度总收入约1870万美元。截止14年12月31日,全年总收入约6千万美元。公司收入大幅增加的主要原因有三方面,其中最重要的是继续贯彻对癌症全面基因组分析的策略;此外还有制药合作方加大对临床试验的支持力度;还有分子信息平台的扩建。

03 Illumina联合军工企业,目标直指本国人民

1月12日,Lockheed Martin公司和Illumina公司宣布达成新的战略联盟,致力于更普适的基因组学研究从而为本国人民提供广泛的个性化医疗服务。据悉,Lockheed Martin公司是全世界最大的国防工业承包商。

04 达安基因一款基因检测试剂盒获批上市

1月13日,达安基因一款基因检测试剂盒“VKORC1和CYP2C9基因检测试剂盒”获国家食药监总局批准上市。该试剂盒用于指导临床医生正确选择及调整华法林用药剂量,大幅度降低华法林用药的风险。

05 DNA测试公司Invitae拟在美IPO

1月13日,DNA测试公司Invitae已向美国证券交易委员会(SEC)提交了IPO申请文件,计划通过IPO交易筹集最多8630万美元资金。Invitae计划在纽约证券交易所挂牌上市,摩根大通、Cowen & Co。和Leerink Partners将担任该公司IPO交易的承销商。

06 百健艾迪与哥伦比亚大学签订基因组研究协议

1月9日,百健艾迪公司与哥伦比亚大学医学部签订了3000万美元的研究协议,用于建立合作科研机构,旨在研究疾病基因组学和发现新的药物靶点。协议内容包括建立一个测序及数据分析机构,以及在哥伦比亚大学设立博士后流动站以促进基因组学研究。

07 卫计委:今年全国血站将采用核酸检测法降低感染风险

近日,国家卫生计生委新闻宣传司司长、新闻发言人毛群安指出,临床用血有风险,2015年要基本实现血站核酸检测全覆盖,使艾滋病窗口期缩短,降低因输血感染疾病的风险。

08 伯豪生物与美国AKESOgen公司达成合作协议

1月13日,上海伯豪生物技术有限公司与美国AKESOgen公司就跨国基因组学服务达成企业战略合作联盟。本次合作可集合两公司技术优势,从而加强双方在美国及亚洲两地的基因组学及药物基因组学项目的合作。

科研简报

01 全球首个青稞基因组图谱发布

1月13日《PNAS》刊登了西藏自治区农牧科学院、西藏自治区大麦和牦牛培育重点实验室、中国科学院、华大等众多研究单位成功绘制全球首个青稞基因组图谱。这是继小麦基因组(A,D),大麦基因组物理图,国际小麦家族基因组研究工作的又一个里程碑式的进步,给未来麦类作物的改良以及其他高原作物的研究工作提供了宝贵的参考资料。

02 我国科学家成功绘制胃癌突变图谱

1月12日《PNAS》刊登了天津医科大学、德克萨斯大学MD安德森癌症中心及加州大学圣地亚哥分校等处研究人员对胃癌的最新研究。研究人员绘制出了中国人群胃癌的突变图谱,并探讨了其对于预后和治疗的意义,为推动胃癌的个体化治疗及开发出新的临床治疗方法指明了方向。

03 中国科学家团队首次解析HPV的基因整合热门位点

1月13日《Nature Genetics》刊登了同济医学院、华中科技大学、南方医科大学以及华大等科研院所组科研人员的最新研究成果。该团队采用全基因组测序的方法结合自主开发的高通量病毒整合筛查技术,对HPV基因整合位点及其潜在的基因整合机制进行了探讨。

04 癌细胞从健康细胞获取线粒体DNA

近日《Cell Metabolism》刊登了新西兰马拉格汉研究中心Mike Berridge小组的最新发现。该小组发现线粒体DNA能在动物肿瘤细胞间移动的团队,还利用最新的基因测序技术证实,肿瘤细胞新获取的线粒体DNA和肿瘤中原有的不一致,但和周围的非肿瘤细胞中的线粒体DNA相同。

05 下一代测序:鉴定罕见乳腺肿瘤突变新工具

近日《Molecular Cancer Research》刊登了密歇根大学综合癌症中心的科学家们出罕见乳腺癌类型(乳腺叶状肿瘤)的遗传标志物。研究人员通过下一代测序技术,定义了乳腺叶状肿瘤的基因组景观图,提出了与组织学分级相关的潜在分子标记,并且扩大了人类肿瘤图谱中与MED12突变相关癌症的范围。

06 血液测试助力患者个性化戒烟

近日《The Lancet Respiratory Medicine》刊登了美国宾夕法尼亚大学、加拿大多伦多大学科研人员的一项新研究。该研究表明通过血液测定吸烟者体内尼古丁分解代谢率,能最有效地帮助戒烟人员选择的戒烟疗法,可显著提高戒烟成功率。

07 Cell子刊:重编程过程中的lncRNA动态

近日《Cell Stem Cell》刊登了加州理工学院的研究团队的最新研究成果。该团队在细胞重编程过程中进行了单细胞转录组分析,揭示了lncRNA表达在不同阶段发生的动态改变,证实了iPS细胞重编程激活了特定组合的功能性lncRNA。

来自:测序中国

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